阿米巴经营需要进行制度化管理。阿米巴单元要根据市场情况不断调整自己，其诞生、分离、合并、撤销发生得较为频繁，一套控制阿米巴单元内部交易的协调管控机制必不可少。

我们通过一个案例来说明这个问题。

柏明顿所服务的一家制造型企业新成立的物流阿米巴被赋予“三大定位”、“四个目标”。

“三大定位”为：

一是在总部管理框架下，实施全收入全成本核算，赋予相应的责权利，提高物流阿米巴盈利能力和资源使用效率，使物流阿米巴成为利润中心。

二是通过物流阿米巴平台，进行公司物流资源的集中管理，统一产品、服务标准和质量管理体系，提升专业管理能力和服务能力，使之成为专业管理中心。

三是通过完善内部交易机制，提高物流板块对内、对外的市场化经营水平和管理水平，成为市场运作中心。

“四个目标”依次是：提升资源配置的责任意识，提升效益，降低成本，改善效率；依据实际业务特点，统一服务标准和服务流程，推动专业化管理；建立内部交易机制，提高面向客户的市场化经营和服务意识；赋予责权利，激发内生动力，增强管理团队和员工队伍的活力。

目标确定以后，该企业立即确定内部交易原则和协调管控机制。明确了五项原则，确立了基于物流阿米巴的公司协调与管控机制，厘清了物流阿米巴与总部的8个职责界面，完善了6个运行相关的保障机制。通过科学的机制设计，有效推动和保障阿米巴经营的推行。